Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4GALNT1Q00973 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4GALNT1Q00973 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms