Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD1P98174 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD1P98174 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD1P98174 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD1P98174 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD1P98174 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD1P98174 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FGD1P98174 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD1P98174 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FGD1P98174 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD1P98174 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD1P98174 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD1P98174 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD1P98174 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD1P98174 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD1P98174 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD1P98174 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD1P98174 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD1P98174 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD1P98174 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD1P98174 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD1P98174 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD1P98174 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD1P98174 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD1P98174 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD1P98174 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGD1P98174 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGD1P98174 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGD1P98174 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD1P98174 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD1P98174 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD1P98174 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD1P98174 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD1P98174 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD1P98174 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD1P98174 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD1P98174 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD1P98174 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD1P98174 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD1P98174 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD1P98174 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD1P98174 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms