Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX3P78415 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX3P78415 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX3P78415 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX3P78415 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX3P78415 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX3P78415 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX3P78415 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IRX3P78415 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX3P78415 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX3P78415 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX3P78415 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX3P78415 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX3P78415 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX3P78415 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX3P78415 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX3P78415 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX3P78415 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX3P78415 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX3P78415 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX3P78415 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX3P78415 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX3P78415 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX3P78415 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX3P78415 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX3P78415 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX3P78415 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX3P78415 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX3P78415 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX3P78415 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX3P78415 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX3P78415 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IRX3P78415 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX3P78415 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX3P78415 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX3P78415 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX3P78415 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX3P78415 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX3P78415 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms