Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2P78314 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms