Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM193AP78312 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM193AP78312 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM193AP78312 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM193AP78312 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM193AP78312 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM193AP78312 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM193AP78312 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM193AP78312 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms