Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA4AP68366 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA4AP68366 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA4AP68366 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA4AP68366 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA4AP68366 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA4AP68366 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA4AP68366 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms