Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2IP63279 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms