Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP1P63208 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP1P63208 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP1P63208 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP1P63208 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP1P63208 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP1P63208 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKP1P63208 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKP1P63208 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKP1P63208 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP1P63208 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP1P63208 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP1P63208 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP1P63208 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP1P63208 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP1P63208 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP1P63208 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKP1P63208 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKP1P63208 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP1P63208 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP1P63208 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP1P63208 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP1P63208 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP1P63208 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP1P63208 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP1P63208 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP1P63208 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP1P63208 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP1P63208 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP1P63208 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP1P63208 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP1P63208 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms