Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms