Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL31P62899 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL31P62899 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL31P62899 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL31P62899 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL31P62899 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL31P62899 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL31P62899 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL31P62899 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL31P62899 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL31P62899 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL31P62899 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL31P62899 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL31P62899 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL31P62899 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL31P62899 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL31P62899 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL31P62899 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL31P62899 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL31P62899 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms