Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPD3P62318 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms