Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RND3P61587 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RND3P61587 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RND3P61587 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RND3P61587 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RND3P61587 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RND3P61587 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RND3P61587 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RND3P61587 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RND3P61587 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RND3P61587 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RND3P61587 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RND3P61587 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RND3P61587 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RND3P61587 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RND3P61587 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RND3P61587 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RND3P61587 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RND3P61587 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RND3P61587 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RND3P61587 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND3P61587 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND3P61587 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms