Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2MP61081 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2MP61081 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms