Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01547P58512 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01547P58512 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms