Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms