Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RIPK4P57078 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RIPK4P57078 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms