Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2BFSP57053 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2BFSP57053 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms