Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC4P56524 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC4P56524 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms