Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH8P55286 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH8P55286 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH8P55286 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH8P55286 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH8P55286 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH8P55286 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH8P55286 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH8P55286 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH8P55286 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH8P55286 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH8P55286 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH8P55286 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH8P55286 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH8P55286 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH8P55286 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH8P55286 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH8P55286 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH8P55286 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH8P55286 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH8P55286 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH8P55286 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH8P55286 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH8P55286 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH8P55286 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH8P55286 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH8P55286 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH8P55286 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH8P55286 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH8P55286 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH8P55286 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH8P55286 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH8P55286 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH8P55286 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH8P55286 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH8P55286 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH8P55286 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH8P55286 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH8P55286 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH8P55286 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH8P55286 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH8P55286 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH8P55286 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH8P55286 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH8P55286 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH8P55286 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH8P55286 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH8P55286 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH8P55286 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH8P55286 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH8P55286 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH8P55286 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH8P55286 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH8P55286 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH8P55286 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH8P55286 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH8P55286 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms