Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB1P54762 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB1P54762 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms