Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMTNP53814 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SMTNP53814 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNP53814 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNP53814 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNP53814 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNP53814 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNP53814 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNP53814 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNP53814 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNP53814 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNP53814 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNP53814 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNP53814 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNP53814 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNP53814 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNP53814 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNP53814 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNP53814 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNP53814 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNP53814 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNP53814 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNP53814 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNP53814 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNP53814 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNP53814 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNP53814 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNP53814 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNP53814 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNP53814 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNP53814 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNP53814 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNP53814 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNP53814 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNP53814 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNP53814 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNP53814 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNP53814 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMTNP53814 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMTNP53814 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMTNP53814 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNP53814 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNP53814 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNP53814 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms