Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUBP1P53384 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUBP1P53384 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms