Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VAV2P52735 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAV2P52735 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VAV2P52735 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAV2P52735 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAV2P52735 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAV2P52735 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAV2P52735 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAV2P52735 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAV2P52735 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAV2P52735 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAV2P52735 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV2P52735 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV2P52735 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV2P52735 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV2P52735 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV2P52735 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV2P52735 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV2P52735 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV2P52735 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV2P52735 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAV2P52735 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VAV2P52735 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAV2P52735 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAV2P52735 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV2P52735 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV2P52735 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms