Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A2P52657 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms