Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms