Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN3P51790 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN3P51790 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms