Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR5P51681 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR5P51681 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR5P51681 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR5P51681 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR5P51681 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR5P51681 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR5P51681 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR5P51681 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR5P51681 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR5P51681 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR5P51681 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR5P51681 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR5P51681 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR5P51681 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR5P51681 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR5P51681 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR5P51681 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms