Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC3P51654 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC3P51654 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC3P51654 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC3P51654 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC3P51654 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC3P51654 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC3P51654 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC3P51654 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC3P51654 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC3P51654 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC3P51654 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC3P51654 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC3P51654 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC3P51654 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC3P51654 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC3P51654 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC3P51654 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC3P51654 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC3P51654 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC3P51654 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC3P51654 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC3P51654 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC3P51654 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC3P51654 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC3P51654 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC3P51654 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC3P51654 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC3P51654 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC3P51654 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC3P51654 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC3P51654 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC3P51654 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC3P51654 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC3P51654 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC3P51654 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC3P51654 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC3P51654 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC3P51654 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC3P51654 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC3P51654 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC3P51654 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC3P51654 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC3P51654 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms