Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5CP51148 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms