Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms