Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1EP49674 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms