Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPFP49454 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPFP49454 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPFP49454 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPFP49454 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPFP49454 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPFP49454 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPFP49454 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPFP49454 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPFP49454 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPFP49454 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPFP49454 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPFP49454 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPFP49454 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPFP49454 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPFP49454 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPFP49454 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPFP49454 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPFP49454 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPFP49454 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPFP49454 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPFP49454 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPFP49454 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPFP49454 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CENPFP49454 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPFP49454 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPFP49454 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPFP49454 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPFP49454 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPFP49454 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPFP49454 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms