Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC34P49427 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC34P49427 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC34P49427 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC34P49427 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC34P49427 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC34P49427 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC34P49427 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC34P49427 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC34P49427 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC34P49427 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC34P49427 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC34P49427 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC34P49427 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC34P49427 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms