Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTBP49356 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTBP49356 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTBP49356 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTBP49356 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTBP49356 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNTBP49356 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNTBP49356 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTBP49356 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTBP49356 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTBP49356 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTBP49356 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTBP49356 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTBP49356 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTBP49356 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTBP49356 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTBP49356 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTBP49356 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms