Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSSP48449 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSSP48449 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSSP48449 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSSP48449 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSSP48449 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSSP48449 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LSSP48449 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSSP48449 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSSP48449 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSSP48449 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSSP48449 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSSP48449 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSSP48449 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSSP48449 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSSP48449 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSSP48449 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSSP48449 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSSP48449 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSSP48449 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSSP48449 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSSP48449 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSSP48449 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSSP48449 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSSP48449 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSSP48449 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSSP48449 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms