Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA8P48165 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA8P48165 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA8P48165 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA8P48165 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA8P48165 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA8P48165 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA8P48165 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA8P48165 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA8P48165 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA8P48165 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA8P48165 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA8P48165 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA8P48165 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJA8P48165 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA8P48165 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA8P48165 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA8P48165 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA8P48165 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA8P48165 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA8P48165 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA8P48165 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA8P48165 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA8P48165 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA8P48165 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA8P48165 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA8P48165 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA8P48165 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms