Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPD2P43304 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPD2P43304 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPD2P43304 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPD2P43304 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPD2P43304 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPD2P43304 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPD2P43304 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPD2P43304 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPD2P43304 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD2P43304 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD2P43304 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD2P43304 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD2P43304 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD2P43304 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD2P43304 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD2P43304 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD2P43304 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD2P43304 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD2P43304 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD2P43304 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD2P43304 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD2P43304 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD2P43304 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD2P43304 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD2P43304 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD2P43304 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD2P43304 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD2P43304 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD2P43304 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD2P43304 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD2P43304 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD2P43304 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD2P43304 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD2P43304 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD2P43304 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD2P43304 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD2P43304 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD2P43304 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD2P43304 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD2P43304 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPD2P43304 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD2P43304 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD2P43304 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms