Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRATP43155 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRATP43155 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRATP43155 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRATP43155 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRATP43155 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRATP43155 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRATP43155 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRATP43155 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRATP43155 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRATP43155 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRATP43155 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRATP43155 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRATP43155 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRATP43155 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRATP43155 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRATP43155 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRATP43155 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRATP43155 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRATP43155 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRATP43155 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRATP43155 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms