Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF5P43026 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF5P43026 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF5P43026 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF5P43026 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF5P43026 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF5P43026 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF5P43026 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF5P43026 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF5P43026 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF5P43026 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF5P43026 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF5P43026 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF5P43026 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF5P43026 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF5P43026 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF5P43026 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF5P43026 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF5P43026 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF5P43026 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF5P43026 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF5P43026 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF5P43026 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF5P43026 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF5P43026 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF5P43026 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF5P43026 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF5P43026 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms