Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACAA2P42765 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms