Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CBP42338 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms