Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CAP42336 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CAP42336 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CAP42336 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms