Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFI27P40305 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFI27P40305 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFI27P40305 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI27P40305 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI27P40305 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI27P40305 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI27P40305 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFI27P40305 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFI27P40305 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms