Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZEB1P37275 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZEB1P37275 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms