Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms