Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCLP35914 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms