Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX5P35711 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX5P35711 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX5P35711 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX5P35711 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX5P35711 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX5P35711 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX5P35711 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX5P35711 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX5P35711 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX5P35711 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX5P35711 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX5P35711 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX5P35711 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX5P35711 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX5P35711 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX5P35711 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX5P35711 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX5P35711 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX5P35711 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX5P35711 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX5P35711 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX5P35711 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX5P35711 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX5P35711 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX5P35711 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX5P35711 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX5P35711 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX5P35711 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX5P35711 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX5P35711 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX5P35711 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX5P35711 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX5P35711 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX5P35711 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX5P35711 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX5P35711 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX5P35711 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX5P35711 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX5P35711 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX5P35711 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX5P35711 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX5P35711 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX5P35711 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX5P35711 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX5P35711 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX5P35711 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX5P35711 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX5P35711 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX5P35711 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX5P35711 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX5P35711 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX5P35711 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX5P35711 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX5P35711 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX5P35711 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX5P35711 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX5P35711 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX5P35711 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX5P35711 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms