Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDIT3P35638 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms