Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPB2P35606 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPB2P35606 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPB2P35606 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPB2P35606 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPB2P35606 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPB2P35606 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPB2P35606 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPB2P35606 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPB2P35606 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPB2P35606 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPB2P35606 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPB2P35606 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPB2P35606 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPB2P35606 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPB2P35606 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPB2P35606 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPB2P35606 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPB2P35606 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPB2P35606 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPB2P35606 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPB2P35606 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPB2P35606 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COPB2P35606 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COPB2P35606 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPB2P35606 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPB2P35606 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPB2P35606 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPB2P35606 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPB2P35606 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPB2P35606 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPB2P35606 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPB2P35606 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPB2P35606 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPB2P35606 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPB2P35606 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPB2P35606 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPB2P35606 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPB2P35606 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPB2P35606 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPB2P35606 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPB2P35606 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPB2P35606 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPB2P35606 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPB2P35606 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPB2P35606 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPB2P35606 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COPB2P35606 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms