Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN1P35523 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN1P35523 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN1P35523 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN1P35523 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN1P35523 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN1P35523 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN1P35523 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN1P35523 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLCN1P35523 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN1P35523 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms